A.F.E es una empresa cuyas funciones son inherentes al transporte público ferroviario, correcto funcionamiento de su material rodante necesario para el servicio, adecuada gestión y explotación de los inmuebles de la Administración, y el cumplimiento de los objetivos señalados en su Plan Estratégico.
Consolidar a A.F.E como una empresa pública moderna, eficiente y sostenible, fortaleciendo su gestión institucional, optimizando la utilización de sus recursos, mejorando la calidad de los servicios ferroviarios y potenciando el valor de sus activos para contribuir al desarrollo del sistema nacional de transporte.